La actriz abandonó la serie al final de la cuarta temporada, en medio de rumores de desavenencias con otros miembros del reparto. Pese a todo, Spelling volvió a confiar en ella para el drama sobrenatural Embrujadas, en el que compartió protagonismo con Holly Marie Combs y Alyssa Milano. Shannen Doherty dio vida a Prue, la mayor de tres hermanas que luchan contra las fuerzas del mal. La serie se estrenó en 1998 y Doherty la abandonó tres temporadas después, de nuevo por problemas con el equipo, especialmente con Milano.

En años siguientes hizo sobre todo telefilmes, aunque volvió a retomar su papel como Brenda en 90210 y BH90210, dos spin-offs que contaron con parte del casting original de Sensación de vivir y que pasaron sin pena ni gloria a finales de la década pasada.  

Para entonces, Shannen Doherty ya había superado por primera vez la enfermedad. La actriz anunció en 2015 que había sido diagnosticada de cáncer de mama. Dos años después comunicó que estaba en remisión, pero la enfermedad regresó con más fuerza en 2020, y esta vez se había extendido al cerebro. En estos últimos meses, la actriz había declarado que había asumido el desenlace y que tanto ella como su familia se estaban preparando para su muerte.